Celebrar y administrar convenios, contratos y acuerdos con los gobiernos nacionales, provinciales y municipales, reparticiones autónomas o autárquicas o con cualquier otra autoridad pública de la República Argentina, del extranjero, de organismos internacionales o con instituciones y personas privadas.

Desde su creación la Fundación tiene como misión apoyar la realización de actividades sustantivas de la Universidad Nacional de San Juan, a través de sus Unidades Académicas, en los campos de Ingeniería, Ciencias Sociales, Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Filosofía, Humanidades y Artes, Arquitectura, Urbanismo y Diseño, mediante la firma de convenios referidos a tareas de transferencia de resultados de investigación y desarrollo de tecnología, de consultoría y asistencia técnica, formación de recursos humanos, formulación y evaluación de proyectos tecnológicos, estudios especiales y estudios de factibilidad entre otros.
En sus 36 años de trayectoria la FUUNSAJ ha desarrollado vínculos de cooperación con organismos, empresas y entidades del país y del extranjero, que requieren la contribución de la Universidad para poder resolver los problemas de creciente complejidad que la realidad plantea.